盈余公积在股权转让中的处理

假定A公司投资M公司的初始投资成本为6000万元，占M公司股份的60%，B公司出资4000万元占M公司的40%股份， A公司准备将其持有股份全部转让给自然人C。自然人C持有N公司股权。截止股权转让前，M公司的未分配利润为5000万元，盈余公积为5000万元。2009年A公司将其股份作价13000万元全部转让给自然人C。

直接转让股权:

A公司股权转让所得=13000-6000=7000万元。应缴企业所得税=7000万×25%=1750（万元），A公司在M公司享有的未分配利润、盈余公积份额不能直接扣减。

先分红，然后盈余公积转增资本，再转让:

M公司先分红，分红后A公司股权转让收入是10000万元(13000-5000*60%)，由于盈余公积无法分红，可以采取盈余公积转增资本的方式，增加股权的计税基础从而降低税负。《公司法》167条规定，分配当年税后利润时，应当提取利润的百分之十列入公司法定公积金。公司法定公积金累计额为公司注册资本的百分之五十以上的，可以不再提取。因此M公司的盈余公积5000万元，恰恰是注册资本1亿元的50%。《公司法》169条规定，法定公积金转为资本时，所留存的该项公积金不得少于转增前公司注册资本的百分之二十五。因此，M公司可以2500万元盈余公积转增资本，转股后公司的注册资本增加至1.25亿元，其中A公司的投资成本变为6000+2500×60%=7500（万元）

因此，A公司股权转让所得=10000-7500=2500（万元），应缴企业所得税=2500×25%=625（万元），和直接转让股权相比，少缴税1075万元