按照流程，专项债可大致分为项目申报与额度分配、债券发行、资金拨付、还本付息几大环节。

1.项目申报与额度分配

在申报前，专项债项目存在准备阶段。项目申报时，申报单位向同级发改、财政部门申请将项目纳入“两库”。省发改委、省财政厅再将初核后的项目提报至国家发改委、财政部相关“项目库”。经审核后，国家发改委向财政部和各省反馈项目清单。

2.债券发行

专项债的额度分配可以概括为：自下而上申请，自上而下分配。一般由各市县财政局根据项目融资需求向省财政厅申请额度，省财政厅汇总全省的情况后，向财政部申请全年的发债额度。全国的地方政府债务限额由全国人民代表大会或其常委会批准，分地区的地方政府债务限额由国务院批准。财政部将批准的分地区额度下达各地，各地财政厅再根据各市县情况核定下达市县债券额度。

3.资金拨付

专项债额度下发后，相关单位准备债券发行材料，进入发债程序。专项债由省财政厅安排发行，发行市场包括银行间债券市场与交易所债券市场。发行方式包括公开发行（公开招标和公开承销）和定向承销发行。

4.还本付息

债券发行后，财政部门及时将资金拨付至项目实施单位，从而真正将资金用到实处，形成实物工作量，促进有效投资。省级政府将对专项债券承担全部偿还责任，按约定还本付息。